研究报告

栽培花生 Aux/IAA 家族鉴定与生物信息学分析  

方月哏旺1,2 , 张晓嘉1,2 , 何华1 , 胡华斌 1* , 陈江华 1*
1 中国科学院西双版纳热带植物园, 中科院热带植物资源可持续利用重点实验室, 昆明, 650223; 2 中国科学院大学, 北京, 100049
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2019年03月28日    接受日期: 2019年04月04日    发表日期: 2020年05月28日
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摘要

Aux/IAA (Auxin/Indole-3-Acetic Acid)家族是生长素(Auxin)信号的早期响应基因家族之一,广泛参与调控植物的生长发育。然而目前对于栽培花生(Arachis hypogaea) Aux/IAA 家族的研究还未见相关报道。本研究在栽培花生中共鉴定到了 34 Aux/IAA 基因,分布在 15 条不同的染色上。多重序列比对分析发现花生 Aux/IAAs 具有 4 个保守结构域,分别为I-IV。聚类分析将花生 Aux/IAAs 分为I-VIII8 个亚家族。各个亚家族内部基因具有相似的保守基序,而基因之间的内含子/外显子结构存在差异。基于基因表达模式分析将栽培花生分为 A B 两组基因,A 组基因在花生各个组织的表达量都相对较高,而 B 组基因的表达具有组织特异性。基于以上结果,本研究将为进一步对 Aux/IAA 家族的基因功能研究提供科学依据。
 

关键词
栽培花生;Aux/IAA;聚类分析;表达模式

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《分子植物育种》印刷版
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